急性髓细胞性白血病（AML）是髓系造血干/祖细胞恶性疾病。以骨髓与外周血中原始和幼稚髓性细胞异常增生为主要特征，临床表现为贫血、出血、感染和发热、脏器浸润、代谢异常等，多数病例病情急重，预后凶险。大约有 20% 的急性髓细胞白血病（AML）患者初始诱导化疗不能达到缓解，完全缓解的患者中大约 50% 最终复发。
因此，临床上根据染色体核型分析、患者临床表现特点、有限数目的基因突变情况进行危险分层，判定患者是否为复发高危人群极为必要。
通过基因检测方法已证实体细胞突变与 AML 预后相关，但没有研究证实非突变区域和调控区域突变可能对初发成人 AML 的预后是否更具有预测价值。另外，AML 患者化疗后白血病细胞清除率监测是否应选用基因检测或是流式细胞学方法进行评估？持久的克隆性细胞遗传学异常已证实具有预测预后的价值，更详细的基因检测可能适用于所有 AML 患者预后评估。
华盛顿大学-圣路易斯医学院的 Klco JM 等对 AML 患者基因进行全面分析，并于近期发表于 JAMA 杂志上。本研究通过检测整个基因组序列（包括编码区和非编码区）中突变基因表达水平，判断是否存在新的初发成人 AML 预后相关的信息。同时，通过监测诱导治疗后白血病细胞突变基因清除率，评估持续的分子学异常是否与预后不良相关。
从纳入的 500 例患者中根据癌症基因组图谱（TCGA）选出 200 例 AML 患者。在此介绍的 71 例患者（平均年龄 50.8 岁）中，已排除良好细胞遗传学分层、缺少密集的诱导化疗或诱导化疗死亡的患者，且有 68 例患者符合 TCGA 标准。
68 例患者于 2002 年 3 月接受标准诱导化疗方案接受密集诱导化疗方案：阿糖胞苷（100 mg/m2×64 例患者，200 mg/m2×4 例患者）、蒽环类（伊达比星或柔红霉素）。再对这些患者的预后进行分层：（1）难治组，接受两个周期的诱导化疗仍不缓解的患者和 6 个月内复发的患者；（2）R6-12 组，即 6 到 12 个月复发的患者；（3）长期第一个缓解组（LFR）, 包括那些仅接受化疗药物而未接受异基因造血干细胞移植，存活超过一年的患者。
另外 3 名不符合 TCGA 标准的患者，两次诱导化疗后达完全缓解状态。随访至 2015 年 1 月，记录 71 例患者一年内复发情况（包括难治组或 R6-12 组）。
71 例患者中 35 例患者诱导缓解 30 天后用石用蜡固定标本，靶向测定白血病特异性突变基因的清除率，其中有 25 个标本进一步测定 DNA 序列。额外增加的 25 例患者的标本也在缓解后 30 天冻存，同样骨髓细胞的冻存也是第一次缓解至少持续一年，或至少一年后复发。
研究对象排除通过全反式维甲酸诱导达缓解 50 例急性早幼粒细胞白血病患者，但包括 6 例染色体异位产生的 RUNX1-RUNX1T1 或 CBFB-MYH11 融合基因。所有患者细胞遗传学分层均通过细胞遗传学或荧光原位杂交进行检测。整个基因组/外显子序列和靶向深入检测基因，根据遗传学资料进行危险分层。
通过目标区域捕获测序方法测定 71 例患者均测定反复出现的 8763 个非编码区域的突变基因反复出现的突变区域。全基因组关联分析工具 Plink 比较分析受等位基因频率影响（LFR 组，25 例患者）和不受等位基因频率影响（难治组，34 例患者）患者生殖细胞多态性。
检测 71 例患者中 45 例（42 例来自 TCGA 研究组，3 例为额外增加难治性患者），即难治组（n = 26）和 LFR 组（n = 19）RNA 序列，以及 24 例难治组和 19 例 LFR 组 MicroRNA (miRNA) 表达水平。
根据现存的遗传学资料标准全面分析 71 例 AML 患者完整的基因组数据，难治组 34 例、R6-12 组 12 例、LFR 组 25 例，AML 中危组多为 LRF 组内患者（n = 52）。FLT3（n = 29 例）、NPM1（n = 28 例）及 DNMT3A（n = 23 例）是最常见的突变基因，对预后有重要的预测价值，并没有出现新的提示预后的信息。主要预后包括突变模式及其与无事件生存期和总生存期的关系。
50 例缓解的患者中，30 天后有 24 例（48%）患者骨髓细胞中白血病相关突变基因至少存在 1 个突变基因（等位基因突变频率（VAF）低于 5%），但与短期复发无明显相关性。
32 例中危组患者中，14 例缓解期骨髓细胞持续存在等位基因突变的患者与 18 例诱导缓解清除等位基因突变的患者相比，无事件生存期明显缩短（中位时间：8.8 个月 vs 25.6 个月），总生存期也缩短（中位时间：19.3 个月 vs 46.8 个月）,DNMT3A、NPM1 与 FLT3 基因突变与无事件生存率无相关性。缓解后 30 天的 VAF 变化阈值为 1% 时，预示着预后不良。
AML 患者第 30 天的缓解期骨髓细胞白血病突变基因持续存在，至少为 5%，其复发风险显著增加，总生存期降低。这一数据表明基因检测方法可提高 AML 患者危险分层。
